ริคาร์โด ฟูจิตะ ผู้เชี่ยวชาญด้านพันธุกรรมชาวเปรูกำลังตรวจสอบยีน
การค้นหาต้นกำเนิดของชาวอินคาเป็นสิ่งที่นักวิจัยพยายามสืบค้นตลอดมา ล่าสุดผู้เชี่ยวชาญด้านวิศวกรรมจากมหาวิทยาลัยซาน มาร์ติน เดอ พอร์เรส ในกรุงลิมาแห่งเปรู เผยถึงการตรวจสอบสารพันธุกรรมหรือดีเอ็นเอ (DNA) เพื่อติดตามแกะรอยเชื้อสายของจักรพรรดิที่ปกครองอาณาจักรอินคา ซึ่งเคยมีเมืองหลวงเก่าแก่ชื่อกุสโก ตั้งอยู่ในพื้นที่ตาวันตินซูยูมานานกว่า 200 ปี ก่อนถูกกองทัพสเปนยึดครองในศตวรรษที่ 16 ปัจจุบันกินพื้นที่ทอดยาวจากฝั่งตะวันตกของอาร์เจนตินาไปจนถึงตอนใต้ของโคลอมเบีย
นักวิจัยได้อาศัย 2 ตำนานเกี่ยวกับที่มาของชนเผ่าอินคาเป็นเบาะแส ตำนานแรกคือคู่สามีภรรยาที่อาศัยอยู่แถวทะเลสาบน้ำจืดตีตีกากาในแคว้นปูโน เป็นทะเลสาบที่ใหญ่ที่สุดในอเมริกาใต้ ส่วนอีกตำนานคือพี่น้องอายาร์ (Ayar brothers) ที่อยู่บริเวณเทือกเขาปาคาริตัมโบในแถบกุสโก โดยนำตัวอย่างดีเอ็นเอของประชากรที่อาศัยอยู่ในปัจจุบันทั้ง 2 แห่งมาศึกษาเปรียบเทียบกับฐานลำดับวงศ์ตระกูลที่มีกว่า 3,000 คน เพื่อทำโครงสร้างความสัมพันธ์ของเครือญาติ จนกระทั่งหดขอบเขตให้เล็กลง พบว่ามีเกือบ 200 คนที่มีความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรม และมีความใกล้เคียงกับชนชั้นสูงของชาวอินคาในสมัยโบราณ

...
ข้อสรุปที่นักวิจัยได้มาคือ ผู้ปกครองสูงสุดของชาวอินคาสืบเชื้อสายมาจาก 2 ตำนาน พร้อมกับยืนยันว่าตำนานทั้งคู่มีความเชื่อมโยงกัน สันนิษฐานว่าการอพยพครั้งแรกของผู้คนยุคนั้นอาจมาจากแคว้นปูโน และมีการสถาปนาปาคาริตัมโบเป็นถิ่นอาศัยนาน 2-3 ทศวรรษ ก่อนที่จะย้ายมายังเมืองกุสโกและสร้างดินแดนตาวันตินซูยูอันกว้างใหญ่ในเวลาต่อมา.