เมื่อประมาณ 500 ปีก่อน เปรูเป็นแหล่งกำเนิดของวัฒนธรรมอินคา ซึ่งครอบครองดินแดนตั้งแต่ตอนใต้ของเอกวาดอร์ โคลอมเบีย ไปจนถึงตอนกลางของชิลี ปัจจุบันเปรูกลายเป็นที่ตั้งของแหล่งโบราณคดีหลายสิบแห่ง เช่น เมื่อหนึ่งเดือนก่อน ก็มีการค้นพบซากกระดูกอายุ 800 ปี ของชนชั้นสูง 11 คน ใกล้กับแหล่งโบราณคดีชานชาน เมืองหลวงของอารยธรรมชิมู บนชายฝั่งทางเหนือของเปรู