ประวัติศาสตร์ประชากรมนุษย์สมัยใหม่ช่วงยุคแรกๆในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ เป็นเรื่องที่ไม่มีใครรู้อย่างแน่ชัด เนื่องจากหลักฐานทางโบราณคดีมีน้อยมาก และสภาพภูมิอากาศในเขตร้อนก็ไม่อาจรักษาสารพันธุกรรม หรือดีเอ็นเอ ของมนุษย์ในยุคโบราณได้