ในสมัยที่หลวงปู่โต๊ะท่านยังมีชีวิตอยู่ ท่านได้สร้างพระเนื้อผงรุ่นแรกไว้ในปี พ.ศ. 2468 จะมีทั้งหมด 13 พิมพ์ด้วยกัน พระเครื่องทั้ง 13 พิมพ์นี้ หลวงปู่โต๊ะได้ลงมือสร้างด้วยความตั้งใจ และปรารถนาจะให้ขลังเป็นพิเศษ ซึ่งได้แก่
1. พระสมเด็จ พิมพ์ขาโต๊ะ (พระพิมพ์นี้หลวงปู่โต๊ะท่านให้เรียกว่า พิมพ์ฐานสิงห์)
2. พระสมเด็จพิมพ์ 7 ชั้น
3. พระสมเด็จพิมพ์ก้างปลา (พิมพ์ใหญ่ พิมพ์ต้อ)
4. พระสมเด็จพิมพ์ปรกโพธิ์ 8 ขีด
5. พระพิมพ์แหวกม่าน
6. พระพิมพ์ซุ้มประตู
7. พระพิมพ์ซุ้มเรือนแก้ว
8. พระพิมพ์พระคง
9. พระพิมพ์หยดน้ำ
10. พระพิมพ์กลีบบัว
11. พิมพ์พระวัดพลับ พิมพ์ยืน พิมพ์นี้มีพิมพ์ใหญ่และพิมพ์เล็ก
12. พระพิมพ์กลีบบัว (กลีบบัวตัด)
13. พระสมเด็จพิมพ์ปรกโพธิ์ 6 ขีด
...
เนื้อผงหรือมวลสาร
หลวงปู่โต๊ะได้ดำเนินการสร้างพระเนื้อผงมาตั้งแต่ก่อน พ.ศ. 2470 เนื้อผงหรือมวลสารที่ใช้ในการสร้างพระได้มาจาก - ผงพระพุทธคุณซึ่งเกิดจากการเขียนอักขระเลขยันต์ ตามสูตรเขียนแล้วลบเก็บผงรวบรวมไว้ (ผงมหาราช อิทธิเจ ปถมัง ตรีนิสิงเห ฯลฯ) - เนื้อผงจากพระวัดพลับที่ชำรุดจำนวนมาก โดยที่ได้รับมอบจากเจ้าคุณสังวรานุวงศ์เถระ (ชุ่ม) เจ้าอาวาสวัดพลับ ซึ่งชอบพอกับหลวงปู่โต๊ะดี - ผงจากพระสมเด็จฯ วัดระฆังฯ โดยฆราวาสบ้านใกล้วัดระฆังเป็นผู้มอบมา (จำนวนไม่มากนัก) - พระผงพระพุทธคุณจากหลวงพ่อกล้าย วัดหงส์ ธนบุรี สหายของหลวงปู่โต๊ะ
